Kurikulum MAS Al Kautsar disusun agar madrasah memiliki pedoman penyelenggaraan kegiatan pembelajaran dan pemenuhan 8 Standar Nasional Pendidikan (SNP) dalam rangka mencapai tujuan pendidikan nasional. Kurikulum MAS Al Kautsar yang berlaku pada tahun pelajaran 2023/2024 di kelas X adalah Kurikulum Merdeka sedangkan kelas XI dan XII menggunakan Kurikulum 2013 . Dalam implementasi Kurikulum Merdeka, kegiatan pembelajaran mengadaptasi kurikulum nasional dengan kebutuhan lokal dan meningkatkan kecakapan literasi melalui pendekatan yang lebih terarah yang diharapkan mampu melahirkan pelajar yang dicita-citakan, yaitu Profil Pelajar Pancasila yang menghendaki karakter dan kemampuan yang dibangun dalam keseharian dihidupkan dalam diri setiap individu peserta didik melalui budaya sekolah, pembelajaran intrakurikuler, proyek penguatan Profil Pelajar Pancasila, maupun ekstrakurikuler. Pelajar Pancasila merupakan perwujudan pelajar Indonesia sebagai pelajar sepanjang hayat yang memiliki kompetensi global dan berperilaku sesuai dengan nilai-nilai Pancasila, dengan enam 2 ciri utama: beriman, bertakwa kepada Tuhan Yang Maha Esa dan berakhlak mulia, berkebhinekaan global, bergotong royong, mandiri, bernalar kritis, serta kreatif.